MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 chromosome

Total Repeats: 75679

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_013851	CG	3	6	71701	71706	0 %	0 %	50 %	50 %	288939827
1502	NC_013851	AGC	2	6	71707	71712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939827
1503	NC_013851	CGC	3	9	71723	71731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939827
1504	NC_013851	GCA	2	6	71735	71740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939827
1505	NC_013851	CGA	2	6	71837	71842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939827
1506	NC_013851	CGG	2	6	71917	71922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939827
1507	NC_013851	ACG	2	6	71941	71946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939827
1508	NC_013851	GGC	2	6	71948	71953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939827
1509	NC_013851	GTG	2	6	71961	71966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288939827
1510	NC_013851	CCAAGG	2	12	71977	71988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939827
1511	NC_013851	TGG	2	6	72016	72021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288939827
1512	NC_013851	CGG	2	6	72112	72117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939827
1513	NC_013851	CGC	2	6	72149	72154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939827
1514	NC_013851	GTCAAC	2	12	72201	72212	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	288939827
1515	NC_013851	GGC	2	6	72213	72218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939827
1516	NC_013851	GCCATC	2	12	72219	72230	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	288939827
1517	NC_013851	AAG	2	6	72303	72308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288939827
1518	NC_013851	CGG	3	9	72329	72337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939827
1519	NC_013851	AGCG	2	8	72524	72531	25 %	0 %	50 %	25 %	288939828
1520	NC_013851	CAT	2	6	72532	72537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939828
1521	NC_013851	AAG	2	6	72539	72544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288939828
1522	NC_013851	CCG	2	6	72553	72558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939828
1523	NC_013851	TGA	2	6	72615	72620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288939828
1524	NC_013851	GGA	3	9	72697	72705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288939828
1525	NC_013851	CGG	2	6	72709	72714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939828
1526	NC_013851	ATC	2	6	72749	72754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939828
1527	NC_013851	CGG	2	6	72763	72768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939828
1528	NC_013851	AGC	2	6	72825	72830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939828
1529	NC_013851	AGA	2	6	72891	72896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288939828
1530	NC_013851	GC	3	6	72934	72939	0 %	0 %	50 %	50 %	288939828
1531	NC_013851	GGCT	2	8	72940	72947	0 %	25 %	50 %	25 %	288939828
1532	NC_013851	CGCGC	2	10	72955	72964	0 %	0 %	40 %	60 %	288939828
1533	NC_013851	A	6	6	72968	72973	100 %	0 %	0 %	0 %	288939828
1534	NC_013851	AAT	2	6	72975	72980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288939828
1535	NC_013851	ACC	2	6	73082	73087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288939829
1536	NC_013851	CAA	2	6	73117	73122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288939829
1537	NC_013851	GCC	2	6	73181	73186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939829
1538	NC_013851	TGA	2	6	73233	73238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288939829
1539	NC_013851	GAGC	2	8	73306	73313	25 %	0 %	50 %	25 %	288939829
1540	NC_013851	CCA	2	6	73335	73340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288939829
1541	NC_013851	TTC	2	6	73346	73351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288939829
1542	NC_013851	CGA	2	6	73363	73368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939829
1543	NC_013851	ACG	2	6	73398	73403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939829
1544	NC_013851	CGG	2	6	73650	73655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939830
1545	NC_013851	CGG	2	6	73659	73664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939830
1546	NC_013851	CGT	2	6	73710	73715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939830
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1550	NC_013851	GCC	2	6	73771	73776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939830
1551	NC_013851	CGA	2	6	73821	73826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939830
1552	NC_013851	GC	4	8	73829	73836	0 %	0 %	50 %	50 %	288939830
1553	NC_013851	GGTC	2	8	73860	73867	0 %	25 %	50 %	25 %	288939830
1554	NC_013851	AAG	2	6	73918	73923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288939830
1555	NC_013851	ATC	2	6	74029	74034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939830
1556	NC_013851	TCG	2	6	74041	74046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939830
1557	NC_013851	CCG	2	6	74087	74092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939830
1558	NC_013851	TGGCTC	2	12	74120	74131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939830
1559	NC_013851	AGG	2	6	74132	74137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288939830
1560	NC_013851	ACG	2	6	74210	74215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939830
1561	NC_013851	CAT	2	6	74229	74234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939830
1562	NC_013851	TGA	2	6	74268	74273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288939830
1563	NC_013851	CGC	3	9	74277	74285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939830
1564	NC_013851	CGA	2	6	74304	74309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939830
1565	NC_013851	CGG	2	6	74346	74351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939830
1566	NC_013851	TGA	2	6	74527	74532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288939831
1567	NC_013851	GC	3	6	74580	74585	0 %	0 %	50 %	50 %	288939831
1568	NC_013851	CAT	2	6	74718	74723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939831
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1571	NC_013851	GC	3	6	74774	74779	0 %	0 %	50 %	50 %	288939831
1572	NC_013851	ATC	2	6	74818	74823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939831
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1574	NC_013851	ACCG	2	8	74897	74904	25 %	0 %	25 %	50 %	288939831
1575	NC_013851	CTG	2	6	74919	74924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939831
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1577	NC_013851	CGTGG	2	10	75038	75047	0 %	20 %	60 %	20 %	288939831
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1587	NC_013851	GTG	2	6	75707	75712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288939832
1588	NC_013851	TCGC	2	8	75715	75722	0 %	25 %	25 %	50 %	288939832
1589	NC_013851	CAG	2	6	75788	75793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939832
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1593	NC_013851	GC	3	6	75974	75979	0 %	0 %	50 %	50 %	288939832
1594	NC_013851	CCA	2	6	76002	76007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288939832
1595	NC_013851	ACC	2	6	76043	76048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288939832
1596	NC_013851	TGA	2	6	76079	76084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288939832
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1598	NC_013851	GAA	2	6	76176	76181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288939833
1599	NC_013851	TTC	2	6	76198	76203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288939833
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1601	NC_013851	CAT	2	6	76308	76313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939833
1602	NC_013851	GCTG	2	8	76331	76338	0 %	25 %	50 %	25 %	288939833
1603	NC_013851	TTC	2	6	76372	76377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288939833
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1606	NC_013851	CG	3	6	76433	76438	0 %	0 %	50 %	50 %	288939833
1607	NC_013851	GCT	2	6	76440	76445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939833
1608	NC_013851	GAT	2	6	76449	76454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288939833
1609	NC_013851	GTC	2	6	76459	76464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939833
1610	NC_013851	ATCT	2	8	76465	76472	25 %	50 %	0 %	25 %	288939833
1611	NC_013851	TGA	2	6	76475	76480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288939833
1612	NC_013851	CTT	2	6	76491	76496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288939833
1613	NC_013851	CTG	2	6	76504	76509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939833
1614	NC_013851	GC	3	6	76535	76540	0 %	0 %	50 %	50 %	288939833
1615	NC_013851	CGG	2	6	76562	76567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939833
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1617	NC_013851	TC	3	6	76587	76592	0 %	50 %	0 %	50 %	288939833
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1619	NC_013851	CTT	2	6	76641	76646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288939833
1620	NC_013851	CTG	2	6	76660	76665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939833
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1622	NC_013851	CAA	2	6	76725	76730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288939833
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1999	NC_013851	TTC	2	6	96415	96420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288939856
2000	NC_013851	TGG	2	6	96428	96433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288939856

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